Le projet de thèse s’inscrit dans le cadre du projet SLOWSLEEP, financé par une ANR JCJC, et s’appuie sur la cohorte prospective multimodale NEUROPREMS, dédiée à l’étude des stades présymptomatiques des maladies neurodégénératives. Le projet vise à mieux comprendre les modifications du sommeil au cours des phases précoces de la neurodégénérescence et leur relation avec les fonctions cognitives. Il s’intéressera notamment aux patients présentant un trouble du comportement en sommeil paradoxal isolé (TCSPi), modèle prodromal des synucléinopathies, et aux sujets présentant des marqueurs précoces de maladie d’Alzheimer.

Le travail reposera sur l’analyse approfondie du sommeil par vidéo-polysomnographie et EEG-32 canaux, associée à une caractérisation cognitive réalisée avant et après le sommeil. Une attention particulière sera portée à l’étude du sommeil lent, notamment les ondes lentes et leurs modifications associées aux processus neurodégénératifs. Le/la doctorant(e) sera accueilli(e) à l’Institut du Cerveau (Paris Brain Institute-CM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, dans un environnement multidisciplinaire associant neurologues et chercheurs en neurosciences. Le projet sera réalisé en interaction étroite l’unité des pathologies du sommeil de l’Hôpital Pitié-Salpêtrière et les équipes impliquées dans la cohorte NEUROPREMS.

Moyens et relations internes :

Le/la doctorant(e) bénéficiera :

• De l’accès aux données cliniques et neurophysiologiques (vidéo-polysomnographie avec EEG-32 canaux) de la cohorte NEUROPREMS ;
• D’un environnement scientifique multidisciplinaire au sein de l’Institut du Cerveau et de l’Hôpital Pitié-Salpêtrière ;

MISSIONS PRINCIPALES

Rattaché(e) à l’équipe de recherche et sous la responsabilité scientifique de Dr Pauline Dodet, le/la doctorant(e) participera à l’ensemble des étapes du projet SLOWSLEEP.

Ses principales missions seront :

• Participer aux acquisitions de sommeil réalisées dans le cadre de NEUROPREMS, notamment aux enregistrements de vidéo-polysomnographie et d’EEG-32 électrodes
• Assurer le contrôle qualité, le prétraitement et l’organisation des données neurophysiologiques
• Étudier les modifications de l’architecture et de la microarchitecture du sommeil aux stades précoces des maladies neurodégénératives
• Développer et appliquer des méthodes d’analyse quantitative du signal EEG de sommeil, avec un intérêt particulier pour le sommeil lent et les ondes lentes
• Analyser les relations entre les marqueurs neurophysiologiques du sommeil et les performances cognitives mesurées avant et après la nuit de sommeil
• Intégrer les données de sommeil aux données cliniques et multimodales disponibles dans NEUROPREMS
• Participer aux analyses statistiques et à l’interprétation des résultats
• Présenter les résultats lors des réunions scientifiques de l’équipe et dans des congrès nationaux et internationaux
• Rédiger des articles scientifiques en anglais et contribuer à leur publication dans des revues internationales.

Le projet permettra au/à la doctorant(e) d’acquérir une expertise en neurophysiologie du sommeil, appliquée aux maladies neurodégénératives à un stade prodromal.

CONDITIONS PARTICULIERES

• Le poste implique une participation aux acquisitions expérimentales réalisées dans le cadre de NEUROPREMS. Certaines acquisitions de sommeil pourront nécessiter une présence en fin de journée, selon l’organisation des protocoles. Des déplacements ponctuels pourront être nécessaires pour participer à des congrès scientifiques, formations ou réunions de collaboration en France ou à l’étranger.

• Durée du contrat : 36 mois.

• Lieu : Institut du Cerveau / Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris

• Salaire : 28 800€

• Master 2 ou diplôme équivalent en neurosciences (sommeil, sciences cognitives, traitement du signal), ou domaine proche permettant une inscription en doctorat.

Savoir-faire

Expérience dans un ou plusieurs des domaines suivants sera particulièrement appréciée :

• Analyse de données EEG ou autres signaux physiologiques sous Python et/ou MATLAB ;

• Manipulation et analyse de données expérimentales issues de tâches cognitives ;

• Analyses statistiques sous R, Python ou logiciels équivalents.

• Expérience préalable en EEG, polysomnographie ou analyse du sommeil constitue un atout mais n’est pas indispensable si le/la candidat(e) possède une motivation pour se former dans ce domaine.

Savoir

Le/la candidat(e) devra disposer de bonnes connaissances générales en neurosciences et d’un intérêt marqué pour :

• La neurophysiologie (analyse du signal EEG) et les fonctions du sommeil ;

• Les maladies neurodégénératives ;

• Les approches quantitatives et multimodales en neurosciences.

• Un bon niveau d’anglais scientifique, écrit et oral, est nécessaire pour la lecture de la littérature, la rédaction d’articles et la présentation des travaux en congrès.

• Capable de communiquer avec des participants en français dans le contexte d’un protocole clinique.

Savoir-être

Le projet nécessite une personne :

• Rigoureuse et organisée, notamment pour l’acquisition, le contrôle qualité et la gestion de données neurophysiologiques complexes

• Disposant d’une forte curiosité scientifique et d’une capacité à développer progressivement une démarche de recherche autonome

• Appréciant le travail en équipe et les interactions multidisciplinaires, dans un environnement associant cliniciens, chercheurs, ingénieurs et spécialistes de différentes modalités

• Autonome dans son travail tout en sachant solliciter les différents experts impliqués

• Motivée par l’apprentissage de nouvelles méthodes d’analyse et par le développement d’outils quantitatifs appliqués aux neurosciences.

L’Institut du cerveau s’engage pour lutter contre toute forme de discrimination. Nous garantissons un environnement de travail inclusif et respectueux de toutes les diversités.

Tous nos postes sont ouverts aux personnes en situation de handicap.

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